В конце отработки каждой задачи конвеера проверять, нет ли зависших сеансов 1С
Для этого предположительно будем использовать программу handle, которая позволяет найти процессы, которые держат открытыми определенные файлы или папки. при помощи этой же обработки будет убивать эти процессы. При этом будем возвращать ошибку, чтобы конкретная задача падала, но при этом весь конвеер не будет зависать.